Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms