Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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VdrP48281 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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VdrP48281 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VdrP48281 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VdrP48281 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VdrP48281 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VdrP48281 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VdrP48281 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VdrP48281 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VdrP48281 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VdrP48281 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VdrP48281 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VdrP48281 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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