Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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