Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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