Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Tead4-203ENSMUST00000130454 1718 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm14834-201ENSMUST00000119416 795 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm2324-201ENSMUST00000187464 662 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm43110-201ENSMUST00000198877 226 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm34358-201ENSMUST00000204585 665 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PtprmP28828 Gm18339-201ENSMUST00000218074 888 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 AC154687.1-201ENSMUST00000224875 677 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Opn1mw-201ENSMUST00000033771 1227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Dbil5-201ENSMUST00000040806 581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Ighv1-9-201ENSMUST00000103498 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 n-R5s51-201ENSMUST00000104473 123 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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PtprmP28828 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 CT033781.3-201ENSMUST00000221886 504 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 AC154669.1-201ENSMUST00000224405 482 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Olfr285-201ENSMUST00000079736 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Cib3-201ENSMUST00000098630 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Esd-201ENSMUST00000022573 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 0610037L13Rik-203ENSMUST00000106726 515 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm13592-201ENSMUST00000118148 1010 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 6330549D23Rik-202ENSMUST00000159536 1102 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Mpv17-204ENSMUST00000200864 878 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm18362-201ENSMUST00000221786 529 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 AC125223.1-201ENSMUST00000224004 749 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm36595-201ENSMUST00000218830 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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