Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms