Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
P10404 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
P10404 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
P10404 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
P10404 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
P10404 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
P10404 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
P10404 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
P10404 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
P10404 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
P10404 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
P10404 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
P10404 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
P10404 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
P10404 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
P10404 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
P10404 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
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