Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hoxd3P09027 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms