Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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