Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P01664 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01664 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01664 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01664 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms