Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 300 ms