Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28048F7BCN0 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms