Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lcn6A2AJB9 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms