Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms