Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.83□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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