Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B2

Ttc25, Tetratricopeptide repeat protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc25Q9D4B2 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc25Q9D4B2 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms