Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp16Q99LG0 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp16Q99LG0 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp16Q99LG0 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp16Q99LG0 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp16Q99LG0 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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