Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ciao1Q99KN2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ciao1Q99KN2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ciao1Q99KN2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Ciao1Q99KN2 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ciao1Q99KN2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ciao1Q99KN2 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ciao1Q99KN2 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms