Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp11Q99K46 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp11Q99K46 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp11Q99K46 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Usp11Q99K46 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp11Q99K46 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp11Q99K46 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp11Q99K46 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp11Q99K46 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp11Q99K46 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Usp11Q99K46 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Usp11Q99K46 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Usp11Q99K46 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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Usp11Q99K46 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp11Q99K46 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp11Q99K46 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Usp11Q99K46 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Usp11Q99K46 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usp11Q99K46 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usp11Q99K46 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp11Q99K46 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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