Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sgms1Q8VCQ6 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sgms1Q8VCQ6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sgms1Q8VCQ6 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sgms1Q8VCQ6 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sgms1Q8VCQ6 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sgms1Q8VCQ6 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sgms1Q8VCQ6 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Sgms1Q8VCQ6 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Sgms1Q8VCQ6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Sgms1Q8VCQ6 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Sgms1Q8VCQ6 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms