Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samd4aQ8CBY1 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms