Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms