Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms