Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms