Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm14276-201ENSMUST00000117941 720 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm16365-201ENSMUST00000122987 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm11959-201ENSMUST00000148655 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm26679-201ENSMUST00000181685 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 AC107851.1-201ENSMUST00000215982 417 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 AC154766.1-201ENSMUST00000226550 936 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 H2afb2-201ENSMUST00000118616 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm5960-201ENSMUST00000188483 406 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Cyp2e1-203ENSMUST00000210235 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Pdha2-201ENSMUST00000057860 2352 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Tead4-203ENSMUST00000130454 1718 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm14828-201ENSMUST00000119381 1155 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Rbm4-201ENSMUST00000164209 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm3617-201ENSMUST00000173076 555 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm33024-201ENSMUST00000203143 633 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm44920-201ENSMUST00000206503 746 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 BC051665-201ENSMUST00000026078 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm13975-201ENSMUST00000119253 782 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 AC139845.1-201ENSMUST00000147013 1334 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm5092-201ENSMUST00000188185 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Cenpn-201ENSMUST00000034205 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm6457-201ENSMUST00000066378 815 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 1810009J06Rik-201ENSMUST00000076638 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm12619-201ENSMUST00000117369 385 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Pcsk2os1-202ENSMUST00000156780 527 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Gm44131-201ENSMUST00000203036 394 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 330.8 ms