Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm44706-201ENSMUST00000206822 815 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Atcayos-201ENSMUST00000129834 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms