Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trak1Q6PD31 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms