Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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