Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 CT025689.5-201ENSMUST00000224316 986 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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PtprdQ64487 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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