Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Pde6a-201ENSMUST00000025468 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Dnm2-203ENSMUST00000115404 3455 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Hyal1-201ENSMUST00000010195 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cyp1a1-202ENSMUST00000216433 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Iqcg-202ENSMUST00000115100 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Nolc1-209ENSMUST00000225780 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm37052-201ENSMUST00000194929 1831 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Prpf31-201ENSMUST00000008517 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Usp10-202ENSMUST00000108988 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Olfm4-203ENSMUST00000228749 2801 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 4930552P12Rik-201ENSMUST00000181198 2496 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 AC168276.1-201ENSMUST00000218963 2385 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms