Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms