Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms