Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms