Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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