Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Pcbd1-202ENSMUST00000218005 361 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms