Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms