Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Cdx4Q07424 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms