Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.1 ms