Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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