Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms