Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms