Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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