Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cd28P31041 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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