Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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