Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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