Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Calb1P12658 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Calb1P12658 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms