Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ScaperF8VQ70 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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