Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cfap46E9Q2C0 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms