Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms