Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atp8b5A3FIN4 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atp8b5A3FIN4 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atp8b5A3FIN4 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms